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１９４８年５月１２日、厚生省が児童福祉法に基づき母子手帖の配布を開始しました。

１９６６年には母子健康手帳に改称され、通常妊娠していることが分かった時点で、市区町村から交付を受ける事が出来ます。

１９９１年には都道府県交付から市町村交付へ変更されたことで、国籍や年齢に関わらず市町村ごとの手帳が交付されるようになりました。

独自に外国語版を作製する市町村も登場しました。

１９８０年代にJICAの研修で日本を訪れていたインドネシア人の医師が、母国での普及を思い立ち、１９８９年からインドネシアでの手帳の配布を開始しました。

１９８８年からは母と子の健康手帳プロジェクトとして、アジアからアフリカへと普及が進められています。